Santa María es una iglesia fortaleza, que comenzó a construirse en 1560 por el maestro Sebastián Segura, sobre los restos de una antigua mezquita.

Es un templo fortaleza debido a la gran inseguridad en toda la costa del Mediterráneo, sirviendo de refugio frente a los numerosos ataques de piratas, corsarios turcos y berberiscos de ahí su escasez de ventanales para estar preparada para posibles asedios, de estilo renacentista, realizada con grandes sillares de piedra, que destaca por su torre, restaurada a principios del siglo XX. Enfrente de la iglesia se encuentra la Estatua de la Mojaquera. Ha sido declarada Monumento de Interés Cultural.

La construcción tiene planta regular con  muros de mampostería a la que se le agregó una capilla en uno de los laterales, y en el otro, se le añadió la sacristía. Esta última tiene acceso a la torre, conectada visualmente con las torres vigías de la costa.

En su interior se encuentra la estructura original de época musulmana, a la que se le han añadido una serie de elementos propios del culto cristiano, entre ellos, las imágenes de la Virgen del Rosario y San Agustín, ambos patrones de Mojácar.

El retablo original desapareció durante la Guerra Civil. En su lugar se encuentra una significativa pintura al fresco realizada en los años 80´ por el pintor alemán Michael Sucker.

Un fresco que representa un Cristo «muy almeriense» y que preside el altar en su ausencia de retablo, ya que el original, desaparecido durante la Guerra Civil (1936-39), fue sustituido por una pintura al fresco realizada entre 1981 y 1982, por el pintor alemán Michael Sucker, por encargo.

El pintor, nacido en Alemania, el en marzo del año 1951, residió en Mojácar durante nueve años. Durante su estancia en este bello pueblo del Levante almeriense, Sucker, diseñó y realizó esta pintura al fresco, que cubre todo el altar principal. Según el mismo artista relata, varios artistas locales recibieron el encargo de realizar un boceto, siendo finalmente elegido el suyo, en el que quiso plasmar el ambiente de Mojácar, su luz, y el Indalo, símbolo de la ciudad, pero cristianizándolo. De este modo, ideó la figura de un Jesús, amable y positivo, vestido de blanco, cubierto por una bóveda celeste en forma de arco, y cuyos extremos parten desde las palmas abiertas de sus manos, formando una gran semicircunferencia, a modo de arco iris. Así cuando se mira a Jesús, se ve también el Indalo de Mojácar.
A la derecha y a la izquierda de este particular Salvador, se retrata el desierto, con su escasez de agua y penurias, como ejemplo del sufrimiento y el esfuerzo humano, el propio pueblo de Mojácar, como símbolo del paraíso en la tierra y el mar con la riqueza natural que aporta.
El fresco también incorpora el símbolo de la sabiduría y la paloma de la paz, o espíritu santo.
Cuenta Michael Sucker, que fue el Ayuntamiento quien inició el encargo, por petición popular, si bien finalmente, fue el pueblo de Mojácar, quién realizó una recolecta general, para pagar al artista, y que este pudiera hacer frente a parte de los gastos que se ocasionaron, tales como preparación de la pared, pigmentos, pinturas y el propio trabajo del autor.
Todo lo anterior es lo que explican, para que se conozca, desde el área de Turismo del Consistorio mojaquero. Además añaden una anécdota, que resulta poco más que curiosa. Y es que Sucker sospechaba y así se produjo, que el presupuesto municipal para dicho fresco, de 15.000 pesetas, finalmente fuese destinado a promocionar el club de fútbol, entonces el artista retrató a la madre del alcalde con un balón de fútbol a los pies, y con una réplica de aquel fresco eclesiástico colgado en la pared trasera del retrato. Este cuadro fue vendido a Charles Baxter (actor americano).

Extraído del articulo de Jennifer Simón «Un Cristo muy almeriense» en Ideal Levante.

Frente a la iglesia se encuentra la imagen de la Mojaquera, ataviada con el traje típico que durante siglos ha acompañado a las mujeres de la localidad.